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28 de nov. de 2023 · The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of local similarity between sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to sequence databases and calculates the statistical significance of matches.
- Nucleotide BLAST
Nucleotide BLAST - Basic Local Alignment Search Tool - BLAST
- Protein BLAST
Protein BLAST - Basic Local Alignment Search Tool - BLAST
- Human
Human - Basic Local Alignment Search Tool - BLAST
- Nucleotide BLAST
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) es un algoritmo y programa informático de alineamiento de secuencias de tipo local, ya sea de ADN, ARN o de proteínas. [1] El programa es capaz de comparar una secuencia problema (también denominada en la literatura secuencia query ) contra una gran cantidad de secuencias que se encuentren en una ...
BLAST es el acrónimo de Basic Local Alignment Search Tool. Fué desarrollado por Altschul en 1990 y es el algoritmo mas empleado por el NCBI. La principal característica del BLAST es su velocidad, pudiendo tomar pocos minutos cualquier búsqueda en la totalidad de la base de datos.
Los algoritmos BLAST comienzan dividiendo la secuencia de consulta en una serie de “palabras” cortas superpuestas y asignando valores numéricos a las palabras. Las palabras por encima de un valor umbral para significancia estadística se utilizan entonces para buscar bases de datos.
La versión actual BLAST de NCBI utiliza tres umbrales X, correspondientes a tres fases de extensión: Primera fase: la primera extensión termina cuando se llega a
BLAST se utiliza habitualmente para comparar una secuencia dada contra toda una base de datos de millones de secuencias. Producen alineamientos locales entre cada pareja de secuencias. Además generan un valor se significación estadística para cada alineamiento.
Download scientific diagram | 9: Tipos de BLAST disponibles en el NCBI from publication: Bioinformática: Aplicaciones en Genómica y Proteómica | La bioinformática es una disciplina que se...
